分裂情感性精神病的真正病因迄今不明确。有人认为是精神分裂症的变异或心境障碍(情感性障碍)的变异，也有人认为是有别于精神分裂症或心境障碍的处于两者之间的另一种精神障碍。目前，认为分裂情感性精神病的发病与遗传、神经内分泌异常等因素有关。
1、遗传因素
通过对一级亲属的对照研究发现，分裂情感性精神病在遗传负荷上介于精神分裂症和心境障碍(双相)之间，推测是这两种疾病的两种基因的联合所致。
2、神经内分泌异常
研究结果存在较大分歧，在分裂情感性精神病抑郁型患者中进行的地塞米松抑制试验，脱抑制率与精神分裂症患者接近，但也有部分患者的内分泌反应和抑郁症患者相似而与精神分裂症患者不同。
3、其他
患者在病前多无明显的个性缺陷。约半数以上的患者似乎存在诱发因素，其中社会心理因素要多于躯体因素。
