发病原因目前尚不十分明确，多数学者认为与孕激素水平低下，雌激素水平增高有关，是雌激素异常刺激的结果，与乳腺囊性增生病的病因相同，几乎70%的导管内乳头状瘤是乳腺增生病的一种伴随病变。
主要病理改变为：
1.大体形态
大导管内乳头状瘤，瘤体位于乳头或乳晕下的大导管内，肿瘤直径一般为0.5～1.0cm，边界清楚，无纤维性包膜，多数为单发，少数可同时在几个大导管内发生，瘤体突出导管腔内，由许多细小的树枝突或乳头粘连在一起而形成“杨梅样”结节，结节有粗细，长短不同的蒂，也可无蒂，一般粗短的乳头状瘤纤维成分较多，切面呈灰白色，质地韧;细长且顶端呈颗粒状鲜红的乳头状瘤，质脆易出血，也易恶变，瘤体所在的部位导管扩张，内有浅黄色或棕色的液体存留，有时杂以黏液或血性液，中，小导管内乳头状瘤位于中小导管内，瘤体呈白色半透明小颗粒状，无蒂，附着于管壁上，大小不等，数量不一，组织较韧，上皮生长旺盛,属癌前病变,癌变率5%～10%。
2.组织形态
由导管上皮细胞及间质增生形成的乳头状肿物突入由扩张导管围成的腔内，以纤维组织和血管构成乳头的轴心，外面被覆1～2层立方或柱状上皮细胞，根据乳头状瘤细胞分化的程度及间质细胞的多少，可将其分为以下3种类型。
(1)纤维型管内乳头状瘤：其特点为乳头粗短，间质内纤维组织层丰富，乳头的表面被覆的上皮多为立方或柱状，也可为上皮与肌上皮双层细胞，细胞排列整齐，分化良好，无异形性，由于瘤体内纤维组织成分较多，故称纤维型管内乳头状瘤，是临床上较为常见的一种。
(2)腺型管内乳头状瘤：导管增生的上皮细胞构成细小的乳头，反复分枝，迂曲，相互吻合形成不规则的腺样结构，间质内纤维组织较少，常呈细条索状夹杂在上皮细胞之间。
(3)移行型管内乳头瘤：其特点为导管上皮高度增生，形成乳头，突入管腔，增生的上皮为立方或低柱状上皮细胞，细胞排列均匀一致，无异形性，排列似移行上皮(图2)，Saphir认为本型既无间质又无腺样结构的实性细胞团，具有潜在的恶性。
