一、发病原因
1、宿主因素：
与年龄、营养状况、免疫力等密切相关。
2、肠道微生物的作用：
弧菌和病毒(包括轮状病毒)不引起迁延性腹泻，除此之外，国外报道多种引起急性腹泻的病原均可在迁延性腹泻粪便中检出。它们可分2组：
(1)急性与迁延性腹泻分离率相等的病原菌：
如痢疾杆菌，沙门菌，产毒素大肠杆菌，空肠弯曲菌，耶氏菌，难辨梭状芽孢杆菌等。
(2)迁延性腹泻分离率较高的病菌：
它们有吸附型大肠埃希杆菌(EAEC)，致病性大肠埃希杆菌(EPEC)和隐孢子虫。
3、肠黏膜继续损害与修复迟缓：
动物实验证实，蛋白质-能量营养不良延缓肠黏膜修复，微量元素锌、铁，维生素A，B12和叶酸缺乏也影响肠黏膜修复。
二、发病机制
1、感染性腹泻的发病机制：
(1)病原体吸附在肠黏膜表面：
但并不侵入和损伤黏膜，主要靠产肠毒素或细胞毒素引起宿主产生分泌性腹泻。肠黏膜上皮细胞不受损害，肠道黏膜完整，大便为稀水样，镜检无白细胞。
(2)病原体直接侵入上皮细胞：
并在上皮细胞繁殖，破坏，进而进入固有层继续繁殖，并引起肠的炎症反应，导致肠黏膜弥漫性水肿，充血，肠腔内含黏液血性渗出物，黏膜坏死，形成浅表溃疡。临床表现腹痛，腹泻，里急后重，黏液脓血便为特征。
(3)破坏肠黏膜绒毛上皮细胞：
这类病原体主要侵犯小肠绒毛上皮细胞，使肠上皮细胞变形，不规则，形成绒毛空胞，上皮细胞脱落，新生之肠上皮细胞功能不健全，消化吸收功能障碍，出现吸收不良现象。
2、非感染性腹泻的发病机制：
(1)渗透性腹泻(osmotic diarrhea)：
是指对一种可吸收的溶质发生吸收障碍，小肠远端和结肠的渗透压增高，导致液体由血浆向肠腔反流增加，使肠内容体积增大，肠管扩张，肠蠕动加速而引起的腹泻。这种情况常见于碳水化合物吸收不良。
渗透性腹泻大多是由于对食物的消化和分解不完全所引起的。
(2)分泌性腹泻(secretory diarrhea)：
肠道对水和电解质的吸收是肠道吸收与分泌的净差。
(3)吸收不良性腹泻：
在正常情况下，消化道内的液体，98%被重吸收，这就要求消化道要有足够的面积与健全的吸收功能。凡能损害消化道内吸收面积，影响消化道吸收功能的疾病，均可影响肠内液体重吸收而导致腹泻。
吸收不良性腹泻大致分以下几种情况，黏膜透过性异常，吸收面积减少，肠黏膜充血，细菌繁殖过多，吸收抑制，淋巴梗阻，肠道运动紊乱所致腹泻。
