病变多由急性肠炎延治或误治诱致，胃肠粘膜充血、水肿、渗出、逐渐加重，其表面片状黄色渗出物，呈弥漫性形成;粘膜皱壁层糜烂面加深或出血量大;表层上皮细胞坏死脱落更加严重，因粘膜血管损伤严重伴出血，更明显可见血浆外渗，粘膜下层有出血，水肿甚至穿孔，或发现肠粘膜紊乱、肠痉挛、肠曲缩短，胃肠或肠曲之间瘘管、结肠袋形成加深或消失、充盈缺损等等，有时可伴发肠憩肉，或直肠恶变、结肠恶变病变。根据临床腹泻量，次数增多，粪便稀薄，甚至水样便，伴有肠鸣，但无里急后重，营养障碍，结合有反复发作史或有慢性肠炎的病因存在，诊断一般不难。
慢性肠道细菌感染性疾病(30%)：
其病因可为细菌、霉菌、病毒、原虫等微生物感染，亦可为过敏、变态反应等原因所致。临床表现为长期慢性、或反复发作的腹痛、腹泻及消化不良等症，重者可有粘液便或水样便。如慢性细菌性痢疾、溃疡型肠结核、沙门氏菌感染、肠道菌群失调。
肠道寄生虫病(20%)：
肠道寄生虫病就是寄生虫在人体肠道内寄生而引起的疾病。常见的有原虫类和蠕虫类。如慢性阿米巴痢疾、慢性血吸虫病、肠鞭毛虫病、结肠小袋纤毛虫病、肠道蠕虫病等。肠道寄生虫的种类多，在人体内寄生过程复杂，其各发育期不一定都在肠道，因此，引起的病变也就并不限于肠道。肠道寄生虫的危害性很大，会导致消瘦和严重程度不等的胃肠道症状如腹痛、呕吐、消化不良等。不同的肠道寄生虫还会造成不同的危害，我国是寄生虫病严重流行的国家之一。防治形势依然十分严峻。
