由于不洁性交，感染了白色念珠菌、滴虫、衣原体、支原体及淋病，淋病双球菌，都可引起包皮龟头炎。非感染因素多是由于包皮过长，清洁不够，包皮和龟头之间的不洁之物，即包皮垢，便会堆积起来，刺激局部的包皮和粘膜发生炎症。
感染性包皮龟头炎是最常见的包皮龟头炎，引起这类感染的致病原有细菌、霉菌或寄生虫等，霉菌中最常引起的是白色念珠菌，除了包皮或龟头有红 肿外，有时可见到小而不规则，呈糜烂型的小白斑覆盖在龟头表面，而阴道滴虫(寄生虫)所引起的包皮龟头炎通常是呈溃疡状的，还有一种糜烂型龟头炎是因细菌 感染，好发于包茎的病患，通常会有恶臭的分泌物，龟头表面会呈现许多小小圆圆且表浅性的糜烂。
包皮龟头炎还有因为局部物理因素如包皮过长或翻转不良、创伤、磨擦、避孕套、肥皂和清洁剂对局部的刺激而引起。
药物所引起的包皮龟头炎常常会有搔痒、灼热感，而且引发感染的部位不像感染性包皮龟头炎那么大面积，而是呈单一或是一小片很表浅类似擦伤，且界限明显，最重要的是有先服用过某种药，其中最常见引起包皮发炎的是四环素。
