尖锐湿疣的主要病因为直接性接触传染，占到了发病率的95%。间接传染比如共用内衣裤、卧具和修脚刀等。尖锐湿疣病毒感染者或病毒携带者，通过性生活极易将病毒传播给性伙伴，也可由于外阴皮肤粘膜接触了有病邪的污秽之物品而感染，如浴巾、浴缸、内衣裤、医疗用品等。还有不注意阴部卫生或在便前不注意洗手。
