本病各期均应注意与结核相鉴别，主要依靠培养及相应的血清学检查，原发性组织胞浆菌病的急性期应与病毒，细菌性及其他真菌性肺部炎症以及弥漫性肺部纤维化，类脂质性肺部病变等相鉴别，急性播散性组织胞浆菌病有脾肿大，淋巴结病变，贫血及白细胞减少时，应与内脏利什曼病，淋巴瘤，传染性单核细胞增多症，马内菲青霉病，痢疾，布鲁菌病等鉴别，皮肤及黏膜损害，应与肿瘤，孢子丝菌病，梅毒，细菌性蜂窝织炎，皮肤结核，弓形虫病或其他系统性真菌感染等相鉴别。
