确诊有赖于内镜下所见和内镜直视下取黏膜活组织检查。
诊断标准：
主要依靠内镜检查确诊。
1.临床表现有消化不良症状，如上腹胀满不适，嗳气、泛酸及隐痛;有时可出现类消化性溃疡的症状，如节律性上腹疼痛，进食后可暂时缓解等;糜烂出血性十二指肠炎可出现黑便或呕血。
2.胃酸分泌量可正常或增高；十二指肠引流液中脱落上皮细胞较多，有白细胞；X线检查有球部激惹，降部一过性痉挛，皱壁粗大，可呈假息肉样；内镜检查、行活检可确诊。
诊断依据：
1.症状酷似溃疡病，虽不致发生梗阻、穿孔，但可引起出血。
2.X线钡餐检查无龛影，无明显变形，粘膜皱壁粗乱，但也可正常。
3.纤维内窥镜见到粘膜充血。水肿、糜烂、出血、血管暴露，皱劈粗糙不平，结节增殖等，但无溃疡。
4.粘毛活检显示绒毛上皮变性、扁平、萎缩，固有膜内大量炎性细胞浸润，淋巴样增殖及胃上皮化生等。
本病需与慢性胃炎，十二指肠腺增生，胃泌素瘤及肠结核和crohn病等引起的十二指肠病变鉴别。
鉴别诊断
1.与十二指肠溃疡相鉴别：
十二指肠炎与十二指肠溃疡有时在症状上有相似之处，二者均可与饮食有关的上腹痛、不适感、可为碱性药物所缓解。单凭临床症状较难鉴别，主要依靠内镜检查明确诊断。
2.与慢性胃炎相鉴别：
慢性胃炎的症状，如上腹部不适或疼痛、消化不良、饱胀、嗳气等与十二指肠炎相似，且两者常同时存在。内镜检查是鉴别二者的主要方法。
3.与胃神经官能症相鉴别：
胃神经官能症与十二指肠炎均可见上腹部疼痛、嗳气、反酸、恶心，呕吐等症。胃神经官能症患者以中年女性为多见，多有精神创伤史，主要表现为间歇性上腹痛、胃脘灼热或不适感、泛酸、嗳气、呢逆等，问或有呕吐。服用抗酸药能使症状减轻，但不能完全缓解。查体上腹部压痛较广泛，且不固定。患者一般情况良好，但常伴有头痛、头昏、乏力、失眠、抑郁或焦虑等神经精神症状。各种器械与生化检查均无异常。
4.与十二指肠慈室相鉴别：
单纯性十二指肠慈室多经其他原因作胃肠钡餐X线造影检查而偶尔发现，患者常无症状。但当想室发炎或有溃疡形成时，则可出现中上腹痛。疼痛常出现于食后，查体中上腹部有固定压痛，有时易与十二指肠炎相混淆。可经X线钡餐检查及内窥镜检查加以鉴别。
5.与慢性胆道疾病相鉴别：
胆道运动功能障碍可引起发作性痉挛性右上腹疼痛，患者以中年女性较多，疼痛多发生于饱餐之后(尤以脂肪餐)，应用碱性药物不能缓解。慢性胆囊炎、胆石症可引起消化不良症状及上腹痛，有时易误诊为十二指肠炎。“B”型超声波及X线胆道造影检查可明确诊断。
