诊断
急性期农民肺诊断：
①接触嗜热放线菌孢子后数小时内发病是其特征(但多误认为系“感冒”)，如有典型的症状，体征反复发作(可认为是自然激发试验)，即可诊断，必要时行辅助检查；
②相应的X线胸片表现；
③肺功能检查；
④血清免疫学检查特异抗体阳性，特别是特异的免疫复合物阳性更有诊断价值。
慢性型患者常因症状迁延不愈，在其急性发作时临床表现又不典型而误诊，故必要时应行血清免疫学检查，甚至行肺活组织检查，结合临床综合判断，此时胸片上的改变已难消失，肺功能减退也明显，诊断不太困难。
鉴别诊断
农民肺应与下列疾病相鉴别：
1.感冒 农民肺急性发病时缺乏上呼吸道症状，结合数小时前接触抗原史不难判断。
2.肺炎 一般细菌性肺炎不难排除，但应与寄生虫，药物过敏以及过敏性肉芽肿性血管炎等过敏性肺炎相区别。
3.肺结核 慢性农民肺病变长期存在，易误为结核病，但后者呈慢性过程，痰内找到结核菌，抗结核治疗有效。
4.慢性支气管炎 反复发作的慢性农民肺患者可有慢性咳嗽，咳痰表现(据调查江南农村的“慢性支气管炎”患者中有20%实为慢性型农民肺)，特别晚期也可合并慢性支气管炎，但结合抗原接触史及血清免疫学检查可区别。
5.支气管哮喘 如前述约10%的农民肺可发生哮喘样症状，但喘息较轻，且全身症状较明显，结合病史，免疫学检查和X线胸片表现可鉴别。
6.特发性肺间质纤维化 农民肺晚期可呈现肺间质纤维化，但结合病史和免疫学检查或肺活组织检查可区别。
农民肺晚期可并发肺源性心脏病，但与慢性阻塞性肺疾病引起的肺心病不同，缺乏肺气肿对心脏区的遮盖，肺动脉瓣，心尖区杂音特别响亮，易误为心瓣膜疾病，超声学检查可鉴别。
