诊断主要依靠X线，上消化道钡餐造影，胃镜或手术来确诊，诊断不明，又有顽固呕吐和上腹膨胀者需手术探查确诊。
1.新生儿期其他原因所致胃穿孔 溃疡，机械性损伤，肠梗阻等所致的穿孔。
2.胎粪性腹膜炎：患儿常无胎粪，或较少胎粪排出，X线显示肠管粘连，肠腔充气扩张，有多个液平，腹腔内，膈下游离气体较少，胃泡影正常，有时可见钙化影。
