脊髓造影诊断硬脊膜下脓肿的准确率相当高，可是如果无梗阻则难以定位，然而，即使利用MRI，明确区分硬脊膜外和硬脊膜下脓肿也是非常困难的，若伴有椎体骨髓炎或椎间盘间隙的感染则提示是硬脊膜外脓肿。
鉴别诊断包括硬脊膜外脓肿，急性横贯性脊髓炎，椎体骨髓炎，硬脊膜外血肿以及椎管内肿瘤，临床上，区别硬脊膜外和硬脊膜下脓肿几乎是不可能的。
