瘘管造影：通过口服染料或者通过插入瘘口的导管或直接用注射器注入瘘管内，行瘘管造影，口服经过稀释的骨炭粉或亚甲蓝后，定时观察瘘口，记录骨炭粉或亚甲蓝排出的量和时间，如有染料经创口排出则瘘诊断明确;根据排出时间，可粗略估计瘘的部位;根据排出量的多少，可初步估计瘘口大小，瘘管造影有助于明确瘘的部位，大小，瘘管的长短，走行以及脓腔范围，还可了解与肠瘘相关的部分肠襻的情况。
1、腹部平片：通过腹部立，卧平片检查了解有无肠梗阻，是否存在腹腔占位性病变。
2、B超：可以检查腹腔内有无脓肿及其分布情况，了解有无胸腹水，有无腹腔实质器官的占位病变等，必要时可行B超引导下经皮穿刺引流。
3、消化道造影：包括口服造影剂行全消化道造影和经腹壁瘘口行消化道造影，是诊断肠瘘的有效手段，常可明确是否存在肠瘘，肠瘘的部位与数量，瘘口的大小，瘘口与皮肤的距离，瘘口是否伴有脓腔以及瘘口的引流情况，同时还可明确瘘口远，近端肠管是否通畅，如果是唇状瘘，在明确瘘口近端肠管的情况后，还可经瘘口向远端肠管注入造影剂进行检查。
对肠瘘患者进行消化道造影检查，应注意造影剂的选择，一般不宜使用钡剂，因为钡剂不能吸收亦难以溶解，而且会造成钡剂存留在腹腔和瘘管内，形成异物，影响肠瘘的自愈;钡剂漏入腹腔或胸腔后引起的炎性反应也较剧烈，一般对早期肠外瘘病人多使用60%泛影葡胺，将60%的泛影葡胺60～100ml直接口服或经胃管注入，多能清楚显示肠瘘情况，肠腔内和漏入腹腔的泛影葡胺均可很快吸收，不需要将60%的泛影葡胺进一步稀释，否则造影的对比度较差，难以明确肠瘘及其伴随的情况，造影时应动态观察胃肠蠕动和造影剂分布的情况，注意造影剂漏出的部位，漏出的量与速度，有无分支叉道和脓腔等。
4、CT：CT是临床诊断肠瘘及其并发腹腔和盆腔脓肿的理想方法，特别是通过口服胃肠造影剂，进行CT扫描，不仅可以明确肠道通畅情况和瘘管情况，还可协助进行术前评价，帮助确定手术时机，炎症粘连明显的肠管CT检查表现为肠管粘连成团，肠壁增厚和肠腔积液，此时手术，若进行广泛的粘连分离，不但不能完全分离粘连，还会造成肠管更多的继发损伤，产生更多的瘘，使手术彻底失败。
5、其他检查：对小肠胆囊瘘，小肠膀胱瘘等应进行胆管，泌尿道造影等检查。
