在病原菌趾部可查到真菌或为须癣毛癣菌，头孢霉，曲霉和镰孢。
1.真菌学检查 收集足够的标本是关键，远端甲下型可用刮匙，牙科刮铲及甲起子取甲下碎屑，近端甲下型可用甲钻或解剖刀，白色浅表型可用刮匙，刮取病变区和正常区交界部位靠近甲床的甲屑，加10% KOH 直接镜检，见到分支菌丝即可支持诊断，帚霉，青霉，曲霉，头孢，镰孢，壳蠕孢和白念珠菌等可形成菌丝与假菌丝而与皮肤癣菌混淆，沙堡琼脂培养应采用两管法(其一不含放线菌酮)，培养6～8周。
2.组织病理学 角质增厚，疏松，角质细胞呈网篮状排列，并有不同程度的破坏，可见裂隙，空腔，甲板内如见细长规则菌丝或关节菌丝，提示为皮肤癣菌，其菌丝多横行生长，少数斜行或纵行生长，有的沿腔壁生长，常位于甲板的外层或内层，当甲板严重受损时，甲板全层均可见密集排列的菌丝和孢子;如检出圆形或椭圆形的小细胞，聚集成团，可见芽生孢子，假菌丝及厚壁孢子，提示为酵母菌，这些菌细胞多位于甲板内层，少数见于甲板外层或中层;甲板中若出现不规则的粗大菌丝，有叶状结构，色泽不均匀，部分呈褐色或黑褐色，生长紊乱，提示为非皮肤癣菌性真菌。
