组织病理检查示在基底层上方，出现裂隙，水疱，疱顶由表皮的大部分组成，疱底为一基底细胞附于真皮乳头上的基底细胞向表皮内腔隙突入，称为绒毛，疱液中有棘层松解细胞，这种细胞大而圆，核浓缩居中，胞浆均匀嗜碱性，核周有一淡染区，真皮浅层轻度水肿，有少量嗜酸性粒细胞，中性粒细胞浸润。
免疫荧光检查：
1.直接免疫荧光：
取皮损周围外观正常皮肤或新起皮损做检查，显示IgG和C3在表皮细胞间呈鱼网状沉积，其他成分有C1q，C4沉积，阳性率为80%～95%，活动性病变者可达100%，少数抗体可为IgM，IgA。
2.间接免疫荧光：
80%～90%患者血清中可检出抗表皮细胞间物质抗体即天疱疮抗体，主要是IgG，少数可IgM，IgA，抗体滴度的高低与疾病活动性呈高度相关性，但疾病早期可假阴性，电镜观察：早期改变是表皮细胞间基质或糖被膜局部或全部溶解，细胞间隙变宽，桥粒彼此分离，后期张力丝从桥粒附着板处脱落，桥粒消失。
