本病的一些患者，当囊肿的病源牙根端突入囊中，牙齿根尖骨质会被吸收倾斜或脱落，角化囊肿易继发感染，皮层吸收而致边缘不清楚，从而造成慢性感染骨质增厚致密，较大的囊肿可影响鼻腔，上颌窦腔，眶内及翼后窝等结构，严重的患者骨质逐渐向周围膨胀，可形成面部畸形，对于囊肿患者进行手术后，术中稍不小心可引起其它术后并发症，且发病率较高，其中包括术后感染，复发及瘘的形成等。
