HUS的肾外损害广泛，有的威胁生命，但随着治疗手段的改进，病死率已降至10%以下，存活者中有持久和严重的肾外后遗症者仅约5%。
1.消化系统病 除前边述及的肠道表现外还可有：①胰腺疾患：胰腺的病理损害也是由血栓性微血管病(TMA)引起，可导致胰腺内，外分泌不足，但有胰腺炎临床表现者并不多，而4%～15%患者可表现出暂时性或永久性糖尿病。②肝脏疾患：可见肝大和转氨酶增高，偶尔发生胆汁淤积性黄疸，未见慢性肝损害与肝功衰竭之报道，肝活检可见小血栓，未发现有肝坏死。③胆囊疾患，可发生胆石症，与快速溶血形成胆红素钙盐结石可能有关。
2.中枢神经系统损害 表现多样，有易激惹，嗜睡，焦虑，也可有幻觉，妄想，木僵甚至昏迷等不同程度的意识障碍，检查可见震颤，惊厥，反射亢进，共济失调，巴氏征(+)及脑神经损害等，脑脊液蛋白定量增高，CT与MRI检查能确定损害的性质和位置。
4.呼吸系统损害 有肺水肿或出血性浸润，尸检能发现肺部微血栓者要比临床有显著原发肺损害者人数多。
5.其他 如皮肤淤斑，口唇疱疹也有发生，HUS患儿尸检中发现肾上腺，甲状腺，胸腺，淋巴结，膀胱和卵巢的微血管系统有血栓，但尚未见与这些解剖损害相关的器官功能障碍报道。
