少年性椎体骨软骨病常发病于青少年快速生长期，绝大多数患者就诊的主要原因是驼背畸形，其中部分患者可能会合并背部疼痛，50%的患者主诉疼痛主要位于畸形部或下背部，活动后加重，通常随生长结束而减轻，接近成熟期后只有25%的患者有较典型症状，如果疼痛位于腰部，而畸形在胸部，则应考虑椎弓根崩裂的可能性。
