不让未经无害化处理的粪便下鱼塘。不要在鱼塘上建厕所或把未经处理的粪便作养鱼的饲料。华支睾吸虫病的流行环节是比较清楚的，只要抓住切断传播途径这个主要环节，再加以对传染源的控制，本病的流行是可以防止的。开展卫生宣传，不吃生的或半生不熟的鱼，虾肉是预防本病最有效的措施;切过生鱼的刀具应洗净再用以免污染，切断传播途径，不用粪便直接喂养鱼苗亦是预防本病的有效措施。
