只要严格粪便管理、讲究卫生、及时治疗阿米巴痢疾，阿米巴肝脓肿是可以预防的。即使发生阿米巴肝炎，如治疗及时。也可预防阿米巴肝脓肿的形成。阿米巴肝脓肿如获得及时合理治疗，预后良好。
注意个人卫生及饮食卫生。饭前便后洗手，饮用开水，生食蔬菜瓜果必须洗干净，并作适当消毒处理，如用食醋或高锰酸钾浸泡。加强身体锻炼，改善饮食结构，增强机体抗病能力。已发现患有阿米巴痢疾的患者应尽早诊治，服用有抗虫作用的药物，如甲硝唑和盐酸吐根硷等，预防阿米巴肝脓肿的发生。中药鸦胆子和白头翁对急慢性阿米巴肠病也有防治效果。
