目前对甲状腺癌病因及发病机制仍不很清楚，像对其他癌发病一样，故尚不能很好预防其发病，但应避免或少接触放射线损伤，正常补碘，改善环境污染，少食致甲状腺肿大物质，有家族遗传倾向者在未来应进行基因治疗，早期诊断甲状腺癌，早期彻底治疗，以防恶化与转移，尽量防止病毒感染，及时治疗病毒感染性疾病，如亚急性甲状腺炎等，加强锻炼，增强体质，提高自身免疫力，防治自身免疫性疾病。
