透明隔囊肿分为症状性与非症状性两种，前者又称为扩张性透明隔囊肿，它可造成室间孔的梗阻，产生头痛、呕吐、视乳头水肿及意识障碍等颅压增高症状。当透明隔囊肿累及下丘脑-隔三角区或影响脑深部的静脉回流时，可出现行为、自主神经以及感觉运动功能的异常。一旦发生脑积水，可压迫视神经通路，引起神经眼科方面的症状。
