对于主动脉瓣窦动脉瘤的诊断，依据病史，体格检查和心脏连续性杂音，再结合X线片及超声心动图检查，一般不难明确，对某些诊断怀疑者，需要作出鉴别诊断时，才需作右心右导管检查或逆行主动脉造影术。
主动脉瓣窦动脉瘤发生破裂后通常破裂入右侧低压心腔，血液从高压的主动脉分流入低压的右心室腔，由于二者存在明显的压力阶差，产生大量的左向右分流，其血流动力学改变类似动脉导管未闭，肺循环血流量增多，右心室负荷加重，引致右心室扩大，肺动脉高压和右心衰竭，主动脉瓣窦动脉瘤破入右心房腔则使右心房压力明显增加，右心房明显扩大，上，下腔静脉血液回流受阻，出现右心衰竭症状，主动脉瓣窦动脉瘤破裂入心包腔则产生急性心脏压塞引起死亡。
主动脉瓣窦动脉瘤常可合并其他心脏畸形，其中最常见的为并发室间隔缺损（约占40～50%），这样更加重左右心室的负荷，亦常伴有主动脉瓣关闭不全，肺动脉口狭窄，主动脉缩窄和动脉导管未闭等。
本病病程进展随着破口大小而异，破口越大，左向右分流量越多，则症状出现早，病情进展快。
未破裂的主动脉瓣窦动脉瘤不呈现临床症状，破裂后才呈现症状，发病年龄多数在20～40岁之间，约有1/3的病人起病急骤，在剧烈劳动时突然感觉心前区或上腹部剧烈疼痛，胸闷和呼吸困难，病情类似心绞痛，病情迅速恶化者，发病后数日即可死于右心衰竭，多数病例破口较小，起病后可有数周，数月或数年的缓解期，然后呈现右心衰竭症状，少数病人由于破口甚少，仅有小量左向右分流，很长时间内病人可无自觉症状，这些病人常因心脏杂音而偶然发现，通过超声心动图，右心导管检查及主动脉造影而诊断。
体格检查：舒张压明显下降，脉压差增大，出现水冲脉，毛细管搏动和股动脉枪击声，心脏检查时在胸骨左缘第3，4肋间可触到震颤，该处可听到典型来回性或连续性粗糙杂音，杂音性质类似动脉导管未闭，但杂音位置较低，主动脉瓣窦动脉瘤破入右心房的病例则常呈现颈静脉怒张，心电图检查：显示左心室肥大或双心室肥大，心肌损害和右束枝传导阻滞，X线胸片：见心脏明显扩大，肺动脉段突出，肺野充血肺纹理增多，超声心动图检查：显示主动脉窦壁波形中段，舒张期主动脉窦壁脱入右心室流出道，右心导管检查：可证实在右房，右室或肺动脉部位血氧饱和度升高，提示该部存在左向右分流，逆行主动脉造影：可明确主动脉窦瘤破口部位及破入的心脏腔室。
