咽狼疮与其他部位的狼疮相同，以隐袭起病和无痛发展为其特点，当面部或鼻部发生狼疮，而咽部又有典型的苹果酱样结节发生时，损害部位结核菌检查阳性，诊断容易，但仍需通过活检方可确诊，本病需与咽结核及三期梅毒相鉴别。
病程进展极慢，病人常不知何时起病，一般症状轻微，常感咽部不适及粘着感，吞咽稍有不便，通常无咽痛，全身情况较好，悬雍垂常为首发部位，继而侵及舌腭弓及软腭，但扁桃体极少受侵犯，按临床经过可分四期。
1.粘膜下浸润期：粘膜苍白，肿胀，微干而有光泽，失去柔软性。
2.结节增生期：狼疮结节色淡红或淡黄，大如小米，多数结节聚集成颗粒状的狼疮病病灶，病灶上的结节有时因粘膜充血不易辨认，涂以肾上腺素液，结节常可显示出典型的苹果酱色。
3.溃疡期：结节溃烂而成溃疡，表面可有白色假膜覆盖，溃疡一般较浅，边缘凸起含有结节，底部常有肉芽。
4.瘢痕形成期：溃疡常可自愈而形成光滑的瘢痕，悬雍垂可因软腭收缩而缩短。
