本病多发生在中年人，男多于女，皮肤及黏膜损伤是本病的诱发因素，当身体抵抗力减弱而又有病原菌入侵时，不但局部发生病变，且可很快侵入淋巴和血液循环，引起内脏器官的病变，口腔黏膜是常见的最先被感染的部位，其次是肺部，近位淋巴结可肿大，根据临床症状的不同将其分为皮肤黏膜型和内脏型。
1.皮肤黏膜副球孢子菌病
病原菌常由口腔黏膜或皮肤进入人体，病损开始时多在齿龈、口腔、上颚、咽喉、鼻腔、口唇和舌部，皮肤损害多由黏膜损害蔓延而来，或是来源于内脏血行播散，或由表浅淋巴结溃破引起皮肤穿破，形成溃疡，多发生于面部，以口周和鼻部常见。
初发黏膜的损害是丘疹或水疱，继而形成溃疡，表面覆盖白色渗出物，基底部有出血点，当病变侵入深部时，可破坏会厌，腭垂，软腭而引起穿孔，产生疼痛，口咽部受累可致吞咽困难，口唇受累可致局部发生硬性水肿，牙龈受累可破坏组织而引起牙齿脱落，病变初期附近淋巴结即肿大，尤其是颈部淋巴结，可发硬，但不疼痛，继而局部可发生坏死、化脓、穿破皮肤而形成瘘管。
2.内脏副球孢子菌病
肺部感染多为原发性的，开始有倦怠、乏力、高热、胸痛、呼吸困难、咳嗽及痰中带血丝，如果是继发于其他病灶和血行播散而来，其肺部临床症状可很轻，肠道感染多由消化道传播，病变多在回盲部，肠道可有广泛的溃疡，伴有腹痛、恶心、呕吐、肝脾大、腹水、腹腔内淋巴结可以肿大，由此而易被误认为结核或肿瘤，病变扩散时可累及胃、胰、肛门等处，如果全身淋巴结肿大，常易误诊为霍奇金病，病情发展时，病变可扩散至中枢神经系统，泌尿生殖系统和肌肉，软骨等处，当肾上腺皮质被累及时，出现艾迪生病的一系列临床症状，X线检查损害常位于肺的下野，多为双侧，损害可呈结节状，浸润性或条纹状，结节可以分散，也可融合，浸润可以局限，也可弥散，一般肺部病变未见有钙化现象，胸膜也很少受累。
