伤寒可依据流行病学资料，临床经过及免疫学检查结果作出临床诊断，但确诊伤寒则以检出致病菌为依据，潜伏期为5～21天，潜伏期长短与感染菌量有关。
1.临床表现 典型伤寒的自然病程约为4周，可分为4期。
(1)初期：相当于病程第1周，起病大多缓慢，发热是最早出现的症状，常伴全身不适，乏力，食欲减退，头痛，腹部不适等，病情逐渐加重，体温呈阶梯形上升，可在5～7天内达到39～40℃，发热前可有畏寒，少有寒战，出汗不多，于本期末常已能触及肿大的脾脏与肝脏。
(2)极期：病程的第2～3周，常伴有伤寒的典型表现，肠出血与肠穿孔等并发症亦较多在本期发生，本期内疾病表现已充分显示。
①高热：稽留热为典型的热型，少数可呈弛张型或不规则热型，高热常持续2周左右，高峰可达39～40℃，亦有超过40℃者。
②消化道症状：食欲缺乏，腹胀，腹部不适或有隐痛，以右下腹为明显，亦可有轻压痛，多呈便秘，少数可有腹泻表现。
③神经精神系统症状：一般与病情之轻重密切相关，患者虚弱，精神恍惚，表情淡漠，呆滞，反应迟钝，听力减退，严重者可出现谵妄，昏迷，亦可呈现虚性脑膜炎表现，这些表现均与严重毒血症状有关，随着体温下降，病情亦逐步减轻与恢复。
④循环系统症状：常有相对缓脉(脉搏加快与体温上升不相称)或重脉，如并发心肌炎，则相对缓脉不明显。
⑤肝脾肿大：本期常可触及肿大的脾脏，质软，有轻压痛，亦可发现肝大，质软，有压痛，肝脾肿大通常为轻度，随病情恢复逐渐回复正常，如并发明显的中毒性肝炎时，可见黄疸，丙氨酸转氨酶上升等肝功能异常。
⑥皮疹：病程第7～12天，部分患者出现皮肤淡红色的小斑丘疹(玫瑰疹)，直径约为2～4mm，压之退色，略略高出皮面，为数不多，一般在10个左右，分批出现，分布以胸腹部为多，亦可见于背部与四肢，大多维持2～4天后消退，此外，出汗较多的患者可见水晶型汗疹(白痱)。
(3)缓解期：病程第3～4周，体温开始波动，并逐渐下降，患者仍觉虚弱，食欲开始恢复，腹胀减轻，肿大的脾脏回缩，压痛减退，本期仍有可能出现各种并发症，包括肠出血，肠穿孔等严重并发症仍可发生。
(4)恢复期：病程第5周，体温回复正常，食欲好转，症状及体征均回复正常，通常需1个月左右才完全康复。
上述经过是典型伤寒的自然病程(图1)，由于患者的免疫状态，入侵菌株毒力，数量，治疗措施是否及时与适当，并发症的发生，以及是否原有慢性疾患等因素影响，临床表现轻重不一。
2.临床类型 除典型过程外，本病又可有下列各型。
(1)轻型：发热在38℃左右，全身毒血症状轻，病程短，1～3周即可恢复，症状不多，缺乏典型伤寒表现，易致误诊和漏诊，儿童病例不少见，亦可见于病前曾接受过伤寒菌苗预防接种者，或发病早期已应用有效抗菌药物治疗者。
(2)暴发型(重型)：起病急，毒血症状严重，病情凶险，发展快，畏寒，高热或过高热，腹痛，腹泻，休克，中毒性脑病，中毒性心肌炎，中毒性肝炎，中毒性鼓肠，亦可并发DIC等，如能早期诊断，及时治疗抢救，仍有可能治愈。
(3)迁延型：起病初始表现与普通型(典型)相同，由于机体免疫力低下，发热持续不退，可达数月之久，弛张或间歇热型，肝脾肿大亦较显著，伴有慢性血吸虫病的伤寒病者常有此型的表现，这种患者的抗菌药物治疗不甚满意，有时需配合抗血吸虫病治疗才能控制病情。
(4)逍遥型：全身毒血症状轻，病人常照常生活，工作，不察觉患病，部分患者则可突然发生肠出血或肠穿孔而就医。
(5)顿挫型：起病较急，近似典型伤寒表现，但在1周左右发热等症状迅速消退而痊愈。
(6)小儿伤寒：小儿伤寒的临床过程表现不典型，年龄越小越不典型;年龄越大，则越接近成人的疾病表现，婴幼儿伤寒，起病急，病情重，呕吐，腹痛，腹泻等消化道症状常见，常出现不规则高热，伴惊厥，脉快，玫瑰疹较少见，外周血象白细胞数增高，常伴发支气管炎或肺炎，学龄儿童则多属轻型或顿挫型，与成人表现近似，病情较轻，病程较短，相对缓脉少见，白细胞数不减少，肠道病变亦较轻，肠出血与肠穿孔并发症也较少。
(7)老年伤寒：症状亦不典型，发热不高，虚弱明显，易并发支气管肺炎与心功能不全，持续的胃肠功能紊乱，记忆力减退，病程迁延，恢复缓慢，病死率较高。
3.复发与再燃
(1)复发：本病易有复发，复发率一般为10%左右，早年应用氯霉素作为特效治疗，复发率曾报告上升达20%，患者在热退后1～3周，临床症状再次出现，但常较轻(偶有较初发严重者)，病程约1～3周，血培养可再获阳性结果，复发多为1次，2次者少见，偶有复发3～4次或以上者，复发的原因与机体免疫功能低下有关，潜伏在体内病灶巨噬细胞内的伤寒杆菌重新繁殖，并入侵血循环，再次引起菌血症而致，复发多见于抗菌治疗不充分的患者。
(2)再燃：在病程的2～3周左右，体温开始波动下降的过程，尚未达正常，持续5～7天，发热又回复上升，再燃时症状可稍明显，血培养可再次阳性，再燃的机制与复发相似。
