后期着色孢菌病病变具有特征性的外观，但早期病变可能被误诊为皮肤癣菌病。暗色丝孢霉病必须通过组织病理学和培养，与众多其他原因引起的面部特殊的皮肤感染和非感染性疾病相区别。普通的苏木素和伊红染色组织标本很易辨认出暗色真菌，表现为分隔的，反映出其自然黑色成分的棕褐色小体。Masson- Fontana黑色素染色可确定其存在。为鉴定致病菌种需作培养。
