原发性肺孢子丝菌病有3种病变类型：①支气管肺炎型：起病急，似急性细菌性肺炎，出现发热，咳嗽，咳痰，疲倦乏力，胸部不适，疼痛等，有时局部可闻及湿性啰音。②慢性空洞型：多数由肺炎型病变迁延而致，肺内结节性病灶融合，软化，坏死，当坏死物破溃入支气管，局部即形成薄壁空洞，临床上病人主要为低热或中等度发热，咳嗽，咳痰，间歇性胸闷，呼吸困难，发绀或呼吸衰竭，甚至死亡。③淋巴结肿大型：主要病变位于肺门或纵隔淋巴结，多数起病隐袭，于体检X线检查时偶然发现肺门或纵隔阴影增大，部分病例可因肿大的淋巴结压迫支气管，导致阻塞性肺病变，出现咳嗽，咳痰，不同程度的发热和胸闷，气急等。
播散型孢子丝菌病，多见于糖尿病，艾滋病，长期应用肾上腺皮质激素和免疫抑制剂等免疫功能低下患者，除肺内病灶广泛严重外，常伴有皮肤，骨骼，肌肉以及肝，肾，脑等重要脏器的侵犯，表现为急性起病，高热，严重乏力，厌食，体重减轻，关节僵直，肌肉骨骼疼痛，黄疸，肾功能损害或全身衰竭，如不积极治疗多数于起病后短期内死亡。
