胃结核的临床表现很不一致，有些无症状或很轻微，有些类似慢性胃炎，胃癌，多数似溃疡病，病人有上腹部不适或疼痛，常伴有反酸嗳气，腹痛与进食无关，幽门梗阻所表现的呕吐多以下午，晚间为重，呕吐物为所进之食物，不含胆汁，潜血可为阴性，呕吐后腹胀减轻，除胃症状外还可伴全身结核症状，如乏力，体重减轻，下午发烧，夜间盗汗等，体格检查上腹有时可触及不规则的包块，有幽门梗阻时，在上腹部可见胃型，蠕动波及震水音。
胃结核无特征性临床表现，X线和胃镜检查又无特异征象，因而临床诊断相当困难，早期报道的病例多经手术或尸检证实，近年经胃镜活检诊断者逐渐增多，从而使部分患者避免了手术。
