GER原临床表现多样，轻重不一，有些症状较典型，如烧心和反胃，有些症状则容易混淆，无特征性，从而忽略了对本病的诊治，多数患者呈慢性复发过程，其临床表现可分为四组，即：
①GER症状，如反胃，反酸。
②由于反流物刺激食管引起的症状，如烧心，胸痛，吞咽时胸痛。
④并发症症状。
1.烧心和反酸 是GER最常见的症状，胃内容物在无恶心和不用力的情况下涌入口腔统称为反胃，反流物中偶含少量食物，多呈酸性或带苦味，此时称为反酸，反酸常伴有烧心，烧心指胸骨后烧灼感或不适，常由胸骨下段向上伸延，常在餐后1h出现，尤其在饱餐后，平卧，弯腰俯拾姿势或用力屏气时加重，可于熟睡时扰醒。
2.咽下疼痛与咽下困难 炎症加重或并发食管溃疡时，可出现咽下疼痛，多在摄入酸性或过烫食物时发生，部分患者有咽下困难，呈间歇性，进食固体或液体食物均可发生，每发生在开始进餐时，呈胸骨后梗塞感，可能是由于食管痉挛或功能紊乱所致，少部分患者发生食管狭窄时则呈持续性咽下困难，进行性加重，对干食尤为明显。
3.胸骨后痛 常有位于胸骨后的烧灼样不适或疼痛，严重时可为剧烈刺痛，可向剑突下，肩胛区，颈部，耳部及臂部放散，酷似心绞痛，多数患者由烧心发展而来，但仍有部分胃食管反流病患者无烧心反酸等典型症状，尤应注意鉴别。
4.其他 有的患者表现为咽部不适有堵塞感，但无真正的吞咽困难，称为癔球症，是由于酸反流引起上食管括约肌压力升高的缘故，重症反流性食管炎因反流物吸入，可导致慢性咽炎，声带炎嘶哑，哮喘发作或吸入性肺炎。
GERD的诊断应基于下述情况：其一，有过多的胃食管反流症状;其二，内镜下可能有反流性食管炎的表现;其三，过多胃食管反流的客观证据，临床上，如患者有典型的烧心和反酸等胃食管反流症状，可作出GERD的初步临床诊断，在GERD诊断的4个依据中：
①典型症状。
②质子泵抑制剂试验(PPI试验)。
③内镜有反流性食管炎证据，并能排除其他原因引起食管病变。
④食管24h pH监测阳性，若①+②为阳性，可作出临床诊断，①+③或①+④阳性则可确诊，文献认为PPE试验(奥美拉唑20mg，2次/d，连用7天)敏感性不亚于单纯24h pH监测，是诊断GERD的安全，简便的临床依据，但若人有吞咽困难，消瘦，恶病质，出血等报警症状，则不宜采用本试验，以免贻误病情，由于内镜检查日趋普及，可察见黏膜形态并作活组织检查，目前，临床上仍作为首选检查方法，此外，对临床表现不典型患者，常需结合内镜，24h食管pH监测和PPI试验等方法进行综合分析作出判断，以证明有无过多的胃食管反流。
