起病隐匿，常在血常规检查时偶被发现，有些病例在出现了血栓形成和出血症状后才明确诊断，主要临床表现有以下几方面：
1.血管与神经系统的表现
早期可有头痛，头昏，眩晕和耳鸣，疲乏，健忘，肢体麻木，多汗等，重者可出现盲点，复视和视力模糊等视觉异常，也可有心绞痛和间歇性跛行，该组症状主要是因红细胞数增加，全血容量增多和血黏度增高而导致的血管扩张，血流缓慢淤滞和组织缺氧所引起的。
2.血栓形成和栓塞症状
可发生在周围动脉，脑动脉和冠状动脉，引起偏瘫和心肌梗死等严重后果，血栓性静脉炎伴栓塞主要发生在肺部，但肠系膜，肝，脾和门静脉也可发生，可引起急腹症，当伴有血小板计数增高时，该组症状发生机会增加。
3.出血症状
血管充血，血管内膜损伤以及血小板第3因子减少等血小板功能紊乱可导致出血倾向，常见为鼻出血，牙龈出血和皮肤黏膜上的瘀点和瘀斑等。
4.组胺增高的表现
本症伴颗粒细胞增加，嗜碱粒细胞也增多，后者富含组胺，组胺释放增加可致消化性溃疡，故本症患者消化性溃疡发生率较正常人高4～5倍，溃疡所致的上消化道出血可威胁生命，皮肤瘙痒也常见，40%发生在热水浴之后，10%可伴荨麻疹。
最常见的体征是出血引起的面部，鼻，耳，唇，手掌和结膜充血，呈暗红色，如酒醉状，视网膜和口腔黏膜也显示充血，动脉血压升高，约3/4以上的患者可有脾脏肿大，由于继发性红细胞增多症通常无脾大，故脾大的体征有一定的鉴别诊断意义，脾大并非因血容量增加所致，故放血治疗时脾脏不会缩小，约1/3患者可有肝大，随疾病发展肿大逐渐明显，肝硬化可发生于晚期，肝脏和脾脏都不肿大的情况见于10%左右的病例，过度充血及髓外造血可能是引起脾脏肿大的主要原因。
