十二指肠良性肿物的临床症状无明显特征性，这是造成许多病人无法早期确诊的主要原因，一些肿瘤早期几乎无临床症状，少部分患者是因为其他疾病剖腹手术时偶然发现，随着肿瘤的增大，大多数患者会出现各种症状。
1.一般症状：
可出现上腹部不适，食欲减退，嗳气，反酸等类似慢性胃炎，胃溃疡病的症状，因此，易与这些消化道疾病相混淆。
2.腹痛：
约30%的十二指肠腺瘤性息肉的病人可出现间歇性上腹部疼痛，伴恶心，呕吐，带蒂的十二指肠息肉位于降部以下时可引起十二指肠空肠套叠，而球部巨大腺瘤可逆行进入幽门，导致急性幽门梗阻，称为球状活瓣综合征(ball valve syndrone)，位于十二指肠的平滑肌瘤由于肿瘤的牵拉，肠管蠕动失调以及瘤体中心坏死而继发的炎症反应，溃疡，穿孔等都可以引起腹痛，巨大良性十二指肠肿物如引起肠管梗阻也可造成相应的腹痛，恶心，呕吐症状。
3.消化道出血：
25%～50%的十二指肠腺瘤和平滑肌瘤的病人可出现上消化道出血症状，这主要是由于肿瘤表面缺血，坏死，溃疡形成所致，临床上主要表现为急性出血和慢性出血，急性出血以呕血，黑便为主;慢性出血则多为持续少量出血，大便潜血试验阳性，可导致缺铁性贫血，也有报道十二指肠巨大错构瘤和血管瘤引起消化道大出血。
4.腹部肿块：
巨大的十二指肠良性肿物可以腹部肿块为主要症状，特别是肠腔外生长的平滑肌瘤，可在腹部体检时扪及肿块，一般较为固定，界限较清楚，其质地因病理性质而异，可柔软而光滑，或坚韧而不平。
5.黄疸：
生长在十二指肠降部乳头附近的良性肿物，如压迫胆道下端及乳头开口部位，可出现不同程度的黄疸。
6.其他：
位于十二指肠部位的神经内分泌肿瘤可根据其肿瘤细胞构成情况引起相应的临床表现，如胃泌素瘤导致的卓-艾综合征;家族性腺瘤性息肉病患者特有的唇及颊黏膜色素沉着等。
