1.疼痛：早期可无任何不适，以后粘液囊肿逐渐增大，压迫囊壁，可引起头痛。
2.复视：囊肿发生于筛窦者眼球向外移位，发生于额窦者眼球向外下方移位。若突入眶内可使眼球移位，并有复视、流泪、视力障碍等症状。
3.眶尖综合征：蝶窦粘液囊肿症状复杂，可致眼球突出，并因压迫眶尖而致失明、眼肌麻痹、眼部感觉障碍和疼痛等症征，称为眶尖综合征。
4.内分泌失调：若囊肿向上发展压迫脑垂体，可引起闭经、性欲减退、尿崩等内分泌失调现象；若压迫颈内动脉还可致该动脉发生血栓。
若蝶窦粘液囊肿自然向前壁破溃，粘液排出到鼻腔(自发间歇性清亮鼻溢)，则以上症状可暂时缓解，此现象有重要诊断意义。
5.其他：脓囊肿除上述局部症状外还可出现高热及周身不适等症状。
