(1)肛门，直肠附近疼痛性病变：肛裂，肛瘘，肛门周围脓肿，直肠炎或直肠溃疡，巨大内痔或内痔合并感染，出血等病变时均可引起肛门括约肌痉挛或者患者惧怕排便，使排便反射消失而导致便秘。
(2)结肠梗阻性病变：肠扭转，肠粘连，肠套叠，肠寄生虫病，肠肿瘤，肠系膜血管栓塞或血栓形成等疾病均可导致肠梗阻，使梗阻上端的粪便不能通过梗阻部，故可导致便秘。
(3)肠道运动反射性抑制：即肠道的正常蠕动功能显著减弱，可见于内脏炎症性疾病，如阑尾炎，急性胰腺炎，胆囊炎，腹膜炎，急性继发性巨结肠等，多系同时发生肠麻痹所致，胆石症，肾结石等疼痛性疾病有时也可发生便秘。
(4)服用某些药物：服用氢氧化铝，阿托品，土霉素及碱式碳酸铋(次碳酸铋)，硫糖铝等药物后，部分患者可发生便秘。
(1)器质性疾病：
①慢性结肠梗阻：如结肠狭窄，良性或恶性大肠肿瘤，大网膜粘连综合征(横结肠受牵拉，而形成锐角，导致内容物通过困难)及其他慢性结肠梗阻性疾病。
②先天性巨结肠：便秘系因肠腔高度扩张，肠麻痹，肠肌肉收缩，蠕动功能消失所致。
③肠道外病变压迫，尤其是直肠，乙状结肠外病变压迫，例如盆腔肿瘤，卵巢囊肿，前列腺肿瘤，腹腔内巨大肿瘤或肿块，腹水等均可压迫肠道。
④脑与脊髓病变：如脊髓炎，各型脑炎，脑肿瘤等，可使排便的正常反射弧发生障碍，而致便秘。
⑤慢性铅，砷，汞与磷等中毒：中毒后可使排便反射消失而致便秘。
⑥慢性全身性疾病：如黏液性水肿，甲状腺功能减退症等，可因排便感觉消失，排便反射迟钝而致便秘。
(2)功能性便秘与便秘型肠易激综合征(IBS)：
①腹肌，肛门部肌肉或结肠平滑肌及肌间神经丛功能障碍，常可引起排便的动力减弱而发生便秘，多见于多次妊娠妇女，慢性肺气肿，营养不良，衰弱，老年及腹腔内脏下垂者。
②直肠扩张，收缩的排便反射迟钝或消失，多见于未能养成每天定时大便习惯者，此时因无粪便刺激的感觉，故正常的排便反射明显减弱，患者久而久之可导致顽固性便秘。
③如摄入饮食过少，或饮食习惯，饮食种类的改变，环境变化等因素均可造成肠蠕动功能减弱而引起便秘。
④情绪的改变，紧张，忧虑等因素可导致肠蠕动功能的减弱，而发生便秘，但多与腹泻交替发生者多见，亦称为肠易激综合征(便秘型)，患者常伴有腹痛或腹部不适。
⑤滥用强泻剂后易导致正常的排便反射减弱或消失，故也可发生便秘，反复使用强泻剂后必然会使便秘更趋严重，甚至造成恶性循环，即便秘-强泻剂-便秘。
目前一般认为，功能性便秘有2种类型：①慢传输型便秘，即肠粪便潴留于结肠内，不能按正常节律，时间排出体外，②功能性出口梗阻型，即由于肛管括约肌功能障碍或盆底肌功能障碍等导致粪便从直肠，肛门排出障碍。
个人体质的差异和环境的影响。
发病机制
食物在空，回肠经消化吸收后，余下的不能再度吸收的食糜残渣随肠蠕动由小肠排至结肠，结肠黏膜再进一步吸收水分及电解质，粪便一般在横结肠内逐步形成，最后运送达乙状结肠，直肠，直肠黏膜受到粪便充盈扩张的机械性刺激，产生感觉冲动，冲动经盆腔神经，腰骶脊髓传入大脑皮质，再经传出神经将冲动传至直肠，使直肠肌发生收缩，肛门括约肌松弛，紧接着腹肌与膈肌同时收缩使粪便从肛门排出体外，以上即是正常的排便反射过程，如果这一排便反射过程的任何一个环节出现障碍时均可导致便秘，以下因素都是发生便秘的重要原因：
1.摄入的食物或水分过少，使肠内的食糜残渣或粪便的量亦少，不足以刺激结肠的正常蠕动。
2.肠道的蠕动减弱或肠道肌肉张力减低。
3.肠腔有狭窄或梗阻存在，使正常的肠蠕动受阻，导致粪便不能下排，例如肠梗阻或左半结肠癌。
4.排便反射过程中任何环节有障碍或病变时均可发生便秘，例如直肠黏膜机械性刺激的感觉减弱，盆腔神经，腰骶脊髓神经病变，肛门括约肌痉挛，腹肌及膈肌收缩运动减弱等。
