(一)发病原因
变性杆菌系肠杆菌科细菌，革兰染色阴性，与人类感染有关的主要为普通变形杆菌和奇异变形杆菌，变形杆菌具有明显多形性，可呈球状或丝状，周鞭毛，在普通培养基上生长良好，具有迁徙生长现象为其重要鉴别特性，培养物有特殊的臭味，血琼脂培养基中可见溶血现象，变形杆菌可存在于土壤，污水及肠道等，工作人员的手部及器械是常见的传播方式。
(二)发病机制
与其他革兰阴性杆菌肺炎类似，主要是吸入口咽部定植的变形杆菌，正常人携带此菌很少，老年，使用抗酸剂或H2受体阻滞剂导致胃液pH升高，个人卫生状况不佳，胃肠道手术者，口咽部变形杆菌定植增加，当机体抵抗力下降而吸入的菌量较多，毒力较强时，肺炎随之发生。
尸检可见到受累的肺脏呈致密的实变，部分可见多发性脓肿，甚至大的空腔，胸腔积液罕见，镜下可见实变的肺泡腔内充填有红细胞，混合渗出的单核细胞和多形核中性粒细胞，部分病人肺泡壁结构破坏，肺泡萎陷肺容积缩小，在发生肺泡毁损坏死的区域内的炎性细胞以中性粒细胞居多数。
