骨嗜酸性肉芽肿病因还未明确，可能对某种致敏原、寄生虫或异物的反应性组织细胞增殖或对某种不明致敏原的免疫反应。病变组织为肉芽组织，质软而脆，但也稍有韧性，边缘骨硬化。镜下可见丰富的增生毛细血管，有许多组织细胞和嗜酸性粒细胞，间杂有不同程度的出血灶和坏死灶。
发病机制：
病变位于髓腔为肉芽样组织，切面呈灰色，灰红色或黄色，质软而脆，局限性骨质破坏的边缘有骨硬化，镜下观察基质由围绕小细胞群或单细胞丰富的网状组织构成，围绕宽广的细胞间网状组织区，内含有数量不等的嗜酸性粒细胞，在组织致密呈实质团块的分布区，嗜酸性粒细胞较少，而在嗜酸性粒细胞较多的分布区，除嗜酸性粒细胞较多外，并常见数量不等的淋巴细胞，浆细胞和泡沫细胞等。
