慢性化脓性中耳炎是导致慢性中耳乳突炎的主要原因，其主要是急性化脓性中耳炎未及时治疗或治疗不彻底，迁延而成;或为急性坏死性中耳炎的直接延续。
鼻、咽部的一些慢性病灶如慢性鼻炎、鼻窦炎、扁桃体炎或腺样体肥大等亦为重要原因。其致病菌多为变形杆菌、金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌等，其中以革兰氏阴性杆菌较多。亦可见到厌氧菌的感染或多种细菌的混合感染。
