男生殖系结核的诊断尚需注意与前列腺癌、淋菌性或非特异性附睾炎以及阴囊内血丝虫病相鉴别。一般无困难，可从病史、化验检查和穿刺活检等资料予以明确。50%以上早期曾有过盆器外的结核病，常见者为肺结核、胸膜炎，其次为结核性腹膜炎、结节性红斑及肾、骨结核等，故有上述疾病史后出现不孕不育表现先需要和本病相鉴别。
