诊断
典型的沙眼，临床上根据睑结膜有乳头和滤泡增生，角膜血管翳及结膜瘢痕的出现，较容易诊断。对早期沙眼的诊断尚有一定困难。有时只能初步诊断为疑似沙眼。WHO要求诊断沙眼时至少符合下述标准中的2条：①上睑结膜5个以上滤泡;②典型的睑结膜瘢痕;③角膜缘滤泡或Herbert小凹;④广泛的角膜血管翳;根据1979年中华医学会眼科分会的决定，沙眼诊断依据为：①上穹窿部和上睑板结膜血管模糊充血，乳头增生或滤泡形成，或二者兼有;②用放大镜或裂隙灯检查可见角膜血管翳;③上穹窿部或(和)上睑结膜出现瘢痕;④结膜刮片有沙眼包涵体。在第1项的基础上，兼有其他3项中之一者可诊断沙眼。
疑似沙眼者：上穹隆部及眦部结膜充血，有少量乳头(乳头为正常组织)增生或滤泡，并已排除其他结膜炎者。
鉴别诊断
(1)结膜滤泡症(conjunctival folliculosis)：常见于儿童，皆为双侧，无自觉症状。滤泡多见于下穹窿部与下睑结膜。滤泡较小，大小均匀相似，半透明，境界清楚，滤泡之间的结膜正常，不充血，无角膜血管翳，无瘢痕发生。沙眼的滤泡多见于上穹隆部与上睑结膜，混浊不清、大小不等、排列不整齐，并有结膜充血和肥厚等症状。
(2)慢性滤泡性结膜炎(chronic follicular conjunctivitis)：常见于学龄儿童及青少年，颗粒杆菌(B.granulosis)可能为其病因。晨起常有分泌物，眼部有不适感。滤泡多见于下穹窿与下睑结膜，大小均匀，排列整齐;结膜虽充血，但不肥厚;1～2年后自愈，无瘢痕形成;无角膜血管翳。
(3)春季结膜炎(vernal conjunctivitis)：此病有季节性，主要症状为刺痒。睑结膜上的乳头大而扁平且硬，上穹窿部无病变，易于鉴别。分泌物涂片中可见嗜酸细胞增多。
(4)包涵体结膜炎(inclusion conjunctivitis)：成年人与新生儿包涵体性结膜炎在结膜刮片中皆可见包涵体，其形态与沙眼包涵体相同，难以分别。但包涵体性结膜炎皆以急性开始，滤泡皆以下穹窿部与下睑结膜为著，无角膜血管翳，数月至1年即可自愈，并不形成瘢痕，可与沙眼鉴别。
