性兴奋障碍可依其概念来判断，在鉴别诊断时，首先应确定患者是否在任何情况下都出现性兴奋障碍，并判断是精神性因素还是器质性因素所致，一般而言，精神性性兴奋障碍多突然起病，与某一精神创伤之间可有暂时的联系，男性在眼快动睡眠时有阴茎自发性勃起，假如在某些情况下能勃起，而在另一种情况下不能勃起，则可能为精神性因素所致，器质性性兴奋障碍一般均伴有性欲减退，精神性不一定有性欲减退。
