诊断标准
诊断的过程正是寻找闭经原因的过程，即确定闭经发生在哪一个环节。
1.病史
主要是月经史，初潮年龄，月经周期等，判断是原发闭经还是继发闭经对分析闭经原因是有帮助的，要了解有无先天性缺陷或其他疾病情况，用药史以及对药物治疗的反应等，还要询问发病前有否任何导致闭经的诱因如精神因素，环境改变或其他疾病等。
2.体格检查
应注意全身情况，发育是否正常，有无畸形，身高体重是否在正常范围，四肢，躯干的比例，智力，营养和健康状况，检查第2性征的发育情况如乳房发育，毛发分布，有无乳汁分泌等，妇科检查应注意内外生殖器的发育，有无缺陷，畸形及肿瘤等。
3.卵巢功能的检查。
4.盆腔B超 子宫碘油造影及内镜检查。
5.鞍区影像学检查，病理检查及染色体检查。
鉴别诊断
下丘脑功能性闭经多发生在从事脑力劳动者，长跑运动员，芭蕾舞演员或受到突然的精神刺激者，可发生在极度劳累或剧烈运动后，年轻未婚女性多见，青春期前后好发，表现为继发性闭经伴有消瘦，体重减轻，营养不良等。
首先须排除下丘脑，垂体的器质性病变，详细了解病因，病情的发展过程，临床表现及辅助检查，结合有关激素测定，加以分析，典型的下丘脑功能性闭经患者，血FSH，LH偏低或接近正常，卵巢功能低下或有一定功能，不典型下丘脑功能性闭经患者，血LSH高而TSH低，类似PCOS，少部分患者表现为FSH，LH偏高接近卵巢早衰。
超声检查显示双卵巢正常大小，卵巢内有小囊泡存在，但小于10个，直径2～8 mm可分布于整个卵巢，间质回声不增强，可与PCOS鉴别。
1.精神性闭经诊断与鉴别诊断 该类患者常有精神刺激史，仅有月经稀发与闭经，可有不孕及体重减轻，有关检查示血皮质醇水平较高，但无相关临床症状;促性腺激素释放激素刺激试验示垂体有反应或对外源性GnRH反应迟钝。
2.神经性厌食症(anorexia nervosa)又名神经性厌食综合征(Anorexia nervosa syndrome)，癔病性消化停止综合征，消瘦综合征 是一种精神神经内分泌紊乱性疾病，近20年来本病在西方国家发病率较高，常见于15～24岁的青年妇女，一般小于25岁，普通人群成年妇女中该病的患病率为1%～2%，男女之比为1∶20，在我国也有逐年增加的趋势。
在诊断之前还必须进行下列相关鉴别诊断：原发性内分泌疾病，如腺垂体功能减退症，Addison病，甲状腺功能亢进症及糖尿病等;胃肠道疾病;慢性感染如结核;肿瘤性疾病如淋巴瘤;其他疾病，如AIDS，脑血管畸形以及下丘脑肿瘤等。
