诊断标准
本病诊断的主要依据是病理检查结果，电镜和免疫荧光检查可以区分Ⅰ型和Ⅱ型，持续性的低补体血症，持续无选择性的蛋白尿(或肾病综合征)伴有严重的多样畸形的红细胞尿，与肾功能下降不成比例的贫血，常提示该病发生，C3肾炎因子和血补体C3同时降低常提示病情活动，低C3血症还见于其他继发性肾小球病如：活动性肝病，白血病，转移性肿瘤，和免疫球蛋白血症，因其有原发病的特征不难鉴别。
由于MPGN常在上呼吸道感染之后急性起病，表现为急性肾炎综合征，甚至半数左右患者抗“O”链球菌感染的证据呈阳性，故应与链球菌感染后肾小球肾炎相鉴别，后者常有肉眼血尿，而血补体水平在2个月内常恢复正常，本病肉眼血尿在发病后第1年内较为少见，而持续的低补体血症则应怀疑本病，另外链球菌感染后肾炎的病理常表现为毛细血管内增生性肾小球肾炎，结合病理检查不难区分。
Ⅳ型系统性红斑狼疮活动期，补体，尤其C3常降低，病理检查有时也有系膜结构向基底膜和内皮间长入形成间位，病变累及广泛，免疫复合物可以沉积于肾小球的各个部位，与本病Ⅰ型有些混淆，但是注意结合临床其他表现和免疫荧光检查的C1q的阳性程度以及血清免疫学检查可加以鉴别。
Ⅰ型的病理检查系膜区明显扩张，可表现为结节性硬化灶，与糖尿病肾小球硬化或者轻链沉积病的光镜改变相似，但是免疫荧光和电镜的结果可以容易地将本病和其他疾病区分开，当然结合临床表现，血生化和血清免疫学检查就更容易鉴别。
应与其他的继发性系膜毛细血管性肾炎相鉴别，如乙肝相关性肾炎，根据病毒血清学及肾脏组织乙肝病毒抗原标志物可以鉴别，冷球蛋白血症临床与病理均与该病相似，但很少见，并且前者有相应的全身表现，病理有肾脏小血管炎和透明血栓形成提示为继发性的病变。
鉴别诊断
诊断MPGN需要排除所有继发性因素，如乙型肝炎或丙型肝炎，艾滋病，其他感染或结缔组织病，MPGN的诊断主要通过组织病理学的检查，随着丙型肝炎相关性MPGN，HIV相关MPGNC的日趋流行，对表面上看似原发性MPGN的患者必须做相应的血清学检查，常见需要鉴别的疾病有：
1.糖尿病肾病
MPGN的结节状损害出现在大多数肾小球中，而糖尿病肾病发生结节状损害的小球相对较少，另外从免疫病理学上可以进行鉴别。
2.淀粉样变肾病
HE，刚果红染色及电镜下完全可以鉴别。
3.轻链肾炎
光镜下与MPGN难以鉴别，免疫病理学可以明确区分。
4.狼疮性肾炎
慢性低补体血症应与狼疮性肾炎进行鉴别，狼疮性肾炎可以出现多种类型的病理学改变，如可出现类似于Ⅰ，Ⅲ型MPGN样的改变，但狼疮性肾炎在肾小球内可有IgG，IgM，IgA，C3，C4，C1q的沉积，即“满堂亮”表现，而MPGN同时出现多种免疫球蛋白及补体沉积的情形罕见。
5.过敏性紫癜肾炎
可出现类似于MPGN样的病理变化，鉴别的要点为紫癜性肾炎肾小球系膜区及毛细血管襻上有大量的IgA沉积，还可表现出皮肤紫癜，关节痛和腹痛等。
6.感染后肾炎
感染后肾炎与MPGN的Ⅰ型有时难以鉴别，但一般感染后肾炎的病程比较短，偶尔感染后肾炎也可发展为MPGN。
