临床多以间歇性，无痛性，肉眼全程血尿就诊，实验室检查，影像学及膀胱镜检查加活检是确诊的最主要方法。
1.膀胱结石 通过膀胱区X线平片，有无不透光阴影，可以做出初步鉴别，阴性结石造影时亦可表现为充盈缺损，而膀胱癌合并结石并不少见，膀胱镜检查是主要手段，在膀胱镜下除看到结石外，还可以看到乳头状或绒毛状新生物，通过活组织检查进一步明确诊断。
2.输尿管囊肿 血尿较少见，合并感染时亦可以有血尿，但不如膀胱肿瘤时那么严重，膀胱造影在膀胱三角区有负影，负影呈蛇头样，位于三角区，表面光滑，B超检查为囊性肿物，随尿液的排出，具有舒缩的变化，膀胱镜检查，见输尿管口有水泡样隆起，由膀胱黏膜覆盖，血管清晰，有和排尿相一致的蠕动。
3.膀胱结核 膀胱结核一般有肾或肺结核病史，有低热，盗汗，食欲减退等全身症状，有米汤样脓尿，尿液检查有大量脓细胞，尿结核菌培养60%阳性，尿液脱落细胞检查无肿瘤细胞，膀胱造影和B超检查时，膀胱内无占位性病变，膀胱镜检查，膀胱内有炎症改变和结核结节，溃疡，无新生物，炎症，溃疡创面需注意与绒毛状膀胱癌相鉴别，膀胱镜取活组织检查对鉴别诊断有重要价值。
4.前列腺增生症 前列腺增生可以有肉眼血尿，突入膀胱的中叶增生与膀胱肿瘤尤需鉴别，肿瘤生长于膀胱颈部或膀胱尿道交界处，可以有排尿困难，前列腺增生，以排尿困难为特点，病史比较长，几年至十几年，排尿困难有逐渐加重的发展过程，直肠指诊触及前列腺增大，中间沟消失，膀胱造影在膀胱颈部显示压迹，有向膀胱内凸入的负影，表面光滑，呈弧形，膀胱镜检查，除见前列腺增大外，膀胱内无新生物，对可疑的病例行活组织检查，有助于诊断。
5.膀胱息肉 本病少见，多发生于慢性炎症，寄生虫及异物刺激，继发感染时有膀胱刺激症状，一般无排尿困难，膀胱造影显示膀胱内充盈缺损，本病主要与膀胱恶性肿瘤鉴别，膀胱息肉的血尿不如恶性肿瘤严重，尿液中找不到瘤细胞，膀胱镜检查，见息肉表面光滑，没有蒂，膀胱恶性肿瘤则表面呈菜花状或绒毛状，易出血，活组织检查有助于明确诊断。
6.肾，输尿管肿瘤 其血尿特点为间歇性无痛性全程肉眼血尿，与膀胱癌类似，可单独发生或与膀胱癌同时存在，必须予以区别，膀胱癌的血尿可伴有膀胱刺激症状或在开始或终末加重，血尿颜色多为鲜红色，血块多为团块状，肾，输尿管肿瘤无膀胱刺激症状，血尿多为暗红色，有时可伴有条索状血块，肾实质肿瘤常伴有腰背部疼痛及肿块，一般经B超，IVU，CT及MRI等检查不难鉴别。
7.腺性膀胱炎 为膀胱癌前病变，临床表现有时与膀胱癌类似，需行膀胱镜检查及活组织检查以鉴别。
