此外，静脉血栓症，DIC实验室诊断以及多次血培养阴性，均有助于非细菌性血栓性心内膜炎的诊断，若结合UCG发现赘生物则更有利于诊断。
本病应与急性感染性心内膜炎，亚急性感染性心内膜炎，Loffer心内膜炎，Libman-Sacks心内膜炎等疾病相鉴别。
