此病的诊断主要根据典型的多灶性脉络膜炎伴有轻至中度的前房和玻璃体炎症反应，荧光素眼底血管造影检查，吲哚青绿血管造影检查，视野检查对诊断有一定的帮助。
鉴别诊断
1.DSF和PIC：同样多发于青年女性，为深层视网膜，RPE和脉络膜的多发性黄色斑点状炎症，后期均可导致脉络膜视网膜的点状瘢痕形成，只是前者似乎像是MCP的后期表现，而后者或许是病变轻微的MCP，若要将三者视为独立的病种，与MCP不同的是DSF在后期可出现视网膜下明显的纤维化样改变，而PIC缺乏前房和玻璃体的炎症表现，并且眼底病灶在荧光素血管造影的早期就呈现为强荧光。
2.眼拟组织胞质菌综合征：眼底表现与MCP极为相似，但无前房和玻璃体的炎症表现，患者无性别差异，患者有在组织胞质菌病发病区停留的病史或阳性的组织胞质菌素皮肤试验，生理盲点扩大的视野改变少见。
3.鸟枪弹样视网膜脉络膜病变：多见老年人并多为HLA-A29表型，病灶缺乏像MCP那样伴有色素的瘢痕。
4.多发性一过性白点综合征：病程短暂，病灶位于外层视网膜，色白且淡，一般不形成脉络膜瘢痕。
5.急性后极部多灶性鳞状色素上皮病变：眼前段多无炎症表现，部分患者可见玻璃体炎症细胞，眼底病灶较大且形状多样，病变痊愈后多不复发。
