本病确诊主要依靠从溃疡病变的周围或基底部刮取组织，或从病变结节处抽出组织液，染色镜检原虫，也可经培养，查鞭毛体而确诊，因本病血液，骨髓，淋巴结内并无原虫，并不引起贫血，白细胞减少等，故用于黑热病的其他诊断方法均不适用于本病的诊断。
本病有时诊断较难，易漏诊，临床上应与麻风，红斑狼疮，酒渣鼻，蕈样肉芽肿，黄色瘤，皮肤结核，结节性梅毒疹，结节病等相鉴别。
