根据病史，临床表现及实验室资料不难做出诊断。
胰腺假性囊肿须与胰腺脓肿和急性胰腺蜂窝织炎鉴别。伴随脓肿的病人常有感染表现。偶尔，假性囊肿可表现为体重下降、黄疸和触及无痛性肿大的胆囊，常首先考虑为胰腺癌。CT扫描显示病变为液性，提示为胰腺囊肿可做出正确诊断。增生性囊肿，还有胰腺囊腺瘤或囊腺癌,约占胰腺囊性病变的5%，术前应与胰腺假性囊肿鉴别。其确切的鉴别诊断主要依靠活检来确定。胰头部假性囊肿应与肝脏及右肾囊肿鉴别体，尾部囊肿应与左肝囊肿，左肾囊肿，脾囊肿鉴别。
