诊断
本病根据再生障碍性贫血，生长迟缓，佝偻病，多尿及脱水，酸中毒，电解质紊乱等相应的临床表现;血生化检查见低血钾，低血磷，低血钠，低血氯性酸中毒，高AKP，低血尿酸，糖尿而血糖正常，全氨基酸尿，尿pH低而尿氨和可滴定酸低;X线检查有骨质疏松，佝偻病表现，均有助于诊断，注意询问家族史，应注意原发病的诊断，如胱氨酸储积病者，眼裂隙灯检查可见角膜有胱氨酸结晶沉着，骨髓或血白细胞中胱氨酸含量增加并见到胱氨酸结晶，对本病确切诊断十分重要，由于多种类型 Fanconi综合征可通过特异性治疗及对症处理取得良好疗效，因此病因诊断尤为重要。
鉴别诊断
1.VATER/VACTERL(vertebral defects,anal atresia,tracheoesophageal fistula, renal defects and radial limb defects) 患者有脊椎缺损，肝门闭锁，气管食管瘘，桡骨及肾脏发育异常，与FA的临床表现有重叠。
2.血小板减少症-桡骨缺失综合征(TAR) 是一种常染色体隐性遗传性疾病，在出生时或新生儿期出现血小板减少伴有桡骨缺失，但双侧拇指存在，没有血液系统恶性肿瘤或实体瘤增加的危险，与FA不同。
3.先天性纯红细胞再生障碍性贫血(DBA) 是以红系祖细胞成熟缺陷为特征，1岁以内出现正细胞或大细胞性贫血，1/3以上的患者有先天畸形，常累及头部(小颌，唇裂)，上肢和泌尿生殖系统，大多数患者为散发，少数为常染色体显性或隐性遗传，以上3种疾病的DEB/MMC试验无染色体断裂增加，可与FA鉴别。
4. Nijmegen断裂综合征 是一种罕见的常染色体隐性遗传性疾病，由NBS1突变引起，以免疫缺陷，小头畸形和对电离辐射超敏为特征，大多数患者是南斯拉夫人，最近的一个研究中，8个俄国的NBS患者，3个有造血异常或AML，因此，临床上与FA非常相似，如果诊断困难可以考虑进行NBS突变检查，表1为各种不同病因下Fanconi综合征的特点和区别。
