本病应与各种器质性胃病、器质性肠病及各种内脏病变(肝、胆、胰)等进行鉴别。
神经性呕吐须与慢性胃病、妊娠呕吐、尿毒症等鉴别，还应着重与颅内占位性病变，特别是脑瘤鉴别;神经性厌食须与胃癌、早期妊娠反应、垂体或肾上皮质功能减退鉴别。肠激惹综合征与早期溃疡性结肠炎、克隆病、结肠癌及痢疾等鉴别，还须与甲状腺功能亢进、吸收不良综合征等鉴别。
