实验室检查
1.常规化验
血常规和生化检查可了解有无贫血、白细胞增多和糖尿病以及电解质和酸碱平衡情况。新鲜粪便检查是诊断急、慢性腹泻病因最重要步骤，可发现出血、吞噬细胞、白细胞、原虫、虫卵、脂肪滴、未消化食物等。隐血试验可检出不显性出血。粪培养可发现致病微生物，如弯曲杆菌属、沙门菌属、志贺菌属、艰难梭菌等。通常水样便培养不易获得阳性结果。此外，耶尔森菌属、邻单胞菌属、肠出血性大肠杆菌属O157：H7、气单胞菌属及非霍乱弧菌属等因不予常规检查而易漏诊。但应强调粪便化验时粪便取材要新鲜，送检应及时，否则会影响诊断，此外，如一次培养阴性时，不能轻易否定感染性腹泻，还应多次送粪便培养，有时会获得阳性结果。
2.胰腺外分泌功能试验
如怀疑腹泻是胰腺疾病所致时，应进行胰腺外分泌功能试验，如试餐试验(Lundh试验)，苯甲酰-酪氨酸-对氨基苯甲酸试验(PABA试验)及促胰泌素试验等。
3.小肠吸收功能试验
(1)粪便中脂肪球，氮含量，肌纤维和糜蛋白酶含量测定：显微镜高倍视野下，脂肪球高达100个以上时(苏丹Ⅲ染色法)，可考虑脂肪吸收不良;粪便中含氮量增加时，考虑系糖类吸收不良;粪便中肌纤维增多，糜蛋白酶含量降低时，都提示小肠吸收不良。
(2)右旋木糖试验：小肠吸收功能不良者，尿中D-木糖排出量常减少。
(3)放射性核素标记维生素B12吸收试验(Schilling试验)：小肠吸收功能障碍者，尿内放射性核素含量显著低于正常。
4.呼气试验
多为14C-三酰甘油呼气试验，脂肪吸收不良者口服14C标记的三酰甘油后，由肺内呼出的14C标记的CO2减少，而粪中14C标记的CO2排出量增多，近年来开展较多的13C呼气试验可观察糖类的吸收情况，对乳糖吸收不良亦有重要的诊断价值，此外还有14C甘氨酸呼气试验等方法。
影像学检查
1.X线检查：钡餐或钡剂灌肠检查可了解胃肠道的功能状态，蠕动情况等，对小肠吸收不良，肠结核，克罗恩病，溃疡性结肠炎，淋巴瘤，结肠癌等有重要诊断价值。
2.B超，CT或MRI检查：可观察肝脏，胆道及胰腺等脏器有无与腹泻有关的病变，对肠道肿瘤性病变也可提供依据，因此，B超，CT及MRI检查对消化吸收不良性腹泻及肿瘤性腹泻等均有辅助诊断价值。
3.结肠镜检查：结肠镜检查对回肠末端病变，如肠结核，克罗恩病，其他溃疡性病变以及大肠病变，如溃疡性结肠炎，结肠，直肠息肉及癌肿，慢性血吸虫肠病等均有重要诊断价值。
4.逆行胰胆管造影检查：对胆道及胰腺的病变有重要诊断价值。
5.小肠镜检查：虽然小肠镜检查未能普遍开展(新型小肠镜即将问世)，但其对小肠吸收不良及Whipple病等有较重要诊断意义，小肠镜直视下可观察小肠黏膜的情况，活组织病理检查可判断微绒毛及腺体的变化等。
6.小肠粘膜活组织检查 某些寄生虫，如贾第虫属、类圆线虫属等感染大便中难以检测到病原菌，弥漫性小肠粘膜病变，如热带性口炎腹泻、乳糜泻、Whipple病、弥漫性小肠淋巴瘤等，可经口插入小肠活检管吸取小肠粘膜作病理检查以帮助诊断。
7.血清胃肠道激素与化学物质测定。
