1.HIV感染者并发肺部细菌性感染血白细胞计数较基础值升高
(因HIV感染者其白细胞基础值常低于正常值)，伴核左移，HIV伴粒细胞缺乏时肺部细菌和真菌 (如曲菌)感染的危险性明显增加。
2.血清LDH
PCP时血清LDH通常升高，但在其他肺部疾病(如细菌性肺炎和结核)或非肺部疾病时亦可升高，故缺乏特异性，LDH在严重PCP患者中具有较高的敏感性，相反病情较轻的PCP则LDH的敏感性差，LDH值与PCP治疗反应及预后相关。
3.动脉血气
HIV感染者并发肺部感染时通常有动脉血气异常，如低氧血症，肺泡-动脉血氧分压差[PO2(A-a)]加大，二氧化碳性碱中毒，但缺乏诊断特异性，对于PCP，则对判断预后和决定是否收住入院，或是否用糖皮质激素有帮助。
4.胸部X线检查
胸片可以为HIV肺部感染的诊断提供线索，并为诊断步骤选择提供参考，细菌性肺炎以局限性病变多见(71%)，弥漫性相对少见(29%);多叶病变占54%，间质性和结节性病变分别占17%和10%，部分患者可并发空洞 (1%)，胸腔积液(7%)，淋巴结肿大(2%)，肺部结核分枝杆菌感染胸部X线表现特点与外周血CD4 计数有关，总体上看粟粒样改变比例较低，仅占6%～9%，若CD4 <200/μl，空洞29%，非空洞性病变58%，并发胸腔积液11%，淋巴结肿大20%;CD4 200～390/μl，空洞与非空洞性病变各占44%，并发胸腔积液11%，淋巴结肿大14%;CD4 >400/μl，空洞型占63%，非空洞型33%，并发胸腔积液3%，无淋巴结肿大，卡氏肺孢子虫肺炎则多为双侧性或弥漫性分布，间质或混合型改变88%，肺泡型12%，合并囊肿7%和蜂窝样病变4%，巨细胞病毒肺炎约有1/3患者胸部X线检查未见异常，分布大多为双侧，占71%，病变呈网状颗粒状33%，肺泡型22%，结节型11%，并发空洞11%，囊肿6%，胸腔积液33%，淋巴结肿大11%，新生隐球菌肺炎多为弥漫性分布76%，病变呈间质或混合型占76%，肺泡型19%，结节型5%，11%并发空洞，淋巴结肿大11%，胸腔积液5%。
5.胸部CT检查
对于肺部多发病变的鉴别诊断有一定帮助，如果大多数结节直径小于1cm，且沿着支气管中心性分布，一般多为肺部机会性感染;如伴有胸腔内淋巴结肿大，且结节大于1cm则考虑新生物，卡波济肉瘤除肺内结节外常伴有支气管周围血管增宽。
6.镓67肺扫描
对于HIV/AIDS患者并发PCP诊断有较高敏感性(99%)，但缺乏特异性(详见PCP一节)。
7.肺功能测试
一氧化碳弥散量(DICO)是检测PCP十分敏感的指标，但缺乏特异性，如果DLCO正常则PCP的可能性极小，胸片正常或未见变化者，若DLCO少于预计值75%，诊断PCP的敏感性为90%，特异性仅为53%。
